Bedingt durch die allgemeine Zielsetzung sowie die bewusst gewählte Ortsbezogenheit aller Projekte sind die Partner des Habitat Forum Berlin vor allem regionale Vertretungen lokaler und internationaler Institutionen der kulturellen, sozialen, ökologischen und ökonomischen translateralen Zusammenarbeit.
Langjährige Kontakte bestehen zu öffentlichen Institutionen, Universitäten, Stiftungen, Interessenverbänden sowie zu einzelnen Wissenschaftlern, Künstlern und Aktivisten in Deutschland und im Ausland. Darüber hinaus pflegt das Habitat Forum Berlin die parallele Zusammenarbeit mit in entwicklungspolitische Netzwerke eingebundenen zivilgesellschaftlichen Gruppen und Nichtregierungsorganisationen.